Genderidentiteit verwijst naar hoe, met welke gender iemand zichzelf definieert. De genderidentiteit kan daarom verschillen van het geslacht dat door de arts werd toegewezen bij de geboorte.

Soms komt de gender waarmee iemand zich identificeert niet overeen met de gender die hem/haar bij de geboorte werd toegewezen en waarin hij/zij is opgevoed. Dit is bijvoorbeeld het geval voor (agender, non-binaire, ...) transgender personen. Wanneer genderidentiteit overeenkomt met het geslacht dat bij de geboorte we toegewezen, spreken we van cisgender-personen. 

Net zoals heteroseksuelen kunnen homoseksuele of biseksuele mensen cisgender of transgender zijn. Genderidentiteit heeft niets te maken met seksuele geaardheid.